Since it is forbidden to bake more than the shiur of challah, and consequently one bakes slightly less, and if so, there is no shiur of challah in each dough, and it is forbidden to separate challah from it. And perhaps you will say: let us separate without a blessing due to the doubt? But even this is impossible, for perhaps afterwards he will place matzah from several doughs into one vessel, and the vessel will combine them for challah, and they will be obligated in challah by law. And he will think that he already took challah, and if there was not a shiur in each one—behold, the challah he took is nothing, and it will result in him eating tevel. Therefore, one should not separate from each dough by itself. And how shall he act? If there are many workers, and they make several doughs—he should take two doughs and stick them to one another slightly, according to the law explained in Yoreh Deah siman 325. And if the doughs are hard—he should place the edge of one upon the edge of the second, and cut challah from both of them and recite the blessing, and cast it into the oven. However, this is a remote thing to separate from the dough, because the time is pressing lest the dough become chametz. Therefore, even though ab initio it is a mitzvah to separate from the dough, nevertheless regarding matzah all of Israel are accustomed to separate after the baking, for the reason that has been explained.
כיון שאסור לאפות יותר משיעור חלה, וממילא דאופין מעט פחות, ואם כן אין בכל עיסה שיעור חלה, ואסור לפרוש ממנה חלה. ושמא תאמר: נפריש בלא ברכה מפני הספק? אך גם זה אי אפשר, דשמא אחר כך יתן מצה שמכמה עיסות לתוך כלי אחת, והכלי יצרפן לחלה, ויתחייבו מדינא בחלה. והוא יסבור שכבר לקח חלה, ואם לא היה בכל אחת כשיעור – הרי החלה שנטל אינו כלום, ונמצא שיאכל טבל. ולכן אין להפריש מכל עיסה בפפני עצמה. וכיצד יעשה? אם יש הרבה עוסקים, ועושים כמה עיסות – יקח שתי עיסות וידבקם זו בזו במקצת, כדין המבואר ביורה דעה סימן שכה. ואם העיסות קשים – יניח קצה האחת על קצה השנית, ויחתוך משתיהם חלה ויברך, וישליכה לתנור. אמנם זהו דבר רחוק להפריש מן העיסה, כי הזמן בהול שמא תתחמץ העיסה. ולכן אף שלכתחילה מצוה להפריש מן העיסה, מכל מקום במצה נהגו כל ישראל להפריש אחר האפייה, מהטעם שנתבאר.