And for the law, our teacher, the Beit Yosef, ruled like the Rif and the Rambam, that if the upper one was perforated it is kosher, and if the lower one was perforated it is treifah. Our teacher, the Rema, wrote that there are those who declare it treifah even if only the upper one was perforated, and such is the custom unless there is a great loss. Thus far his words. The great later authorities forbid it even in a case of great loss, since the opinion of the Bahag is to declare it treifah if either one of them is perforated, and all his words are words of tradition [Bach and Taz and Shach, and so wrote the Yam Shel Shlomo, Perek Elu Tereifot, siman 11]. It is simple that the perforation must be through-and-through, but if only half the membrane was perforated, it is nothing and it is kosher. If a portion of the membrane rotted or dissolved, its law is like one that was perforated. One should not ask why regarding the lung we permit it if both membranes were not perforated, as written in siman 36, yet regarding the brain we declare it treifah, for we do not compare tereifot to one another. Furthermore, in the lung the two membranes are equal and attached to the lung, which is not the case in the brain, where each of the membranes has an advantage and a disadvantage: the upper membrane is strong and thick, but its primary attachment is to the bone; and the lower membrane is thin and weak, and its primary attachment is to the brain. Therefore, there are arguments for both sides. According to the opinion of our teachers, the authors of the Tosafot, the primary one is the upper, and according to the Rif and the Rambam, the primary one is the lower. Who can decide a Torah prohibition between the fathers of the world? Therefore, I wonder at one who wishes to be lenient in a case of great loss when only the upper one was perforated [see Pri Chadash and Tevuot Shor, and in my humble opinion the primary view is like those who are stringent because of the differences of opinion between the Tosafot and the Rif and the Rambam, and delve into this].
ולדינא פסק רבינו הב"י כהרי"ף והרמב"ם דניקב העליון כשרה וניקב התחתון טרפה ורבינו הרמ"א כתב דיש מטריפין ג"כ בניקב העליון לבד והכי נהוג אם לא בהפסד מרובה עכ"ל וגדולי אחרונים אוסרין אפילו בהפסד מרובה כיון דדעת בה"ג להטריף באחד מהם וכל דבריו דברי קבלה [ב"ח וט"ז וש"ך וכ"כ ביש"ש פא"ט סי"א] ופשוט הוא דהנקב צריך להיות מפולש אבל אם רק חצי הקרום ניקב אינו כלום וכשרה ואם נרקב מקצת הקרום או נתמסמס דינו כניקב ואין לשאול למה בריאה מכשרינן בלא ניקבו שני הקרומים כמ"ש בסי' ל"ו ובמוח מטרפינן דאין מדמין בטרפות זל"ז ועוד דבריאה שני הקרומים שוין ומדובקים לריאה משא"כ במוח שלכל אחד מהקרומים יש מעלה וחסרון שהקרום העליון חזק ועב אך עיקר דיבוקו להעצם והקרום התחתון דק וחלש ועיקר דיבוקו להמוח ולכן יש פנים לכאן ולכאן ולדעת רבותינו בעלי התוס' העיקר הוא העליון ולהרי"ף והרמב"ם העיקר הוא התחתון ומי יכול להכריע באיסור תורה בין אבות העולם ולכן תמיהני על מי שרוצה להקל בהפסד מרובה בניקב העליון בלבד [עפר"ח ותב"ש ולענ"ד העיקר כהמחמירים מפני חלוקי דיעות שבין התוס' והרי"ף והרמב"ם ודו"ק]: